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        1. 科研動態
          濕地所主持的院優秀青年創新人才項目順利結題
          時間:2021-09-03 來源:濕地所 文字: 圖片: 編輯:烏日娜 點擊:


          鳥類為適應環境變化發展出了相應的對策,腸道微生物在宿主食物消化、營養吸收、能量代謝、生理調節、免疫防御等方面發揮了重要作用。宿主與腸道微生物發生協同進化的同時,但也可能在一定條件下形成致病菌危害宿主健康,甚至導致種群衰落。聯合分析宿主遺傳變異和腸道微生物多樣性的研究還比較少。

          濕地研究所劉剛副研究員承擔了院優秀青年創新人才項目“大鴇及近緣種的基因組變異和腸道微生物研究”已通過驗收,順利結題。

          該項目以大鴇及其近緣種為研究對象,基于比較基因組學、轉錄組學和宏基因組學,主要結果為:(1)基于線粒體基因組和基因組超保守原件構建的系統發育樹,支持鴇科鳥類和蕉鵑目和鵑形目鳥類形成姊妹群,一定程度上厘清了大鴇和近緣種系統發生關系。同時,發現差異表達基因集和溫度相關的基因集的表達譜呈現出溫度相關的聚類模式,且在不同性別間聚類模式不同,暗示了溫度變化可能驅動血液轉錄組發生適應性可塑,同時也暗示性選擇在不同性別個體應對環境脅迫時發揮作用。(2)不同性別的大鴇在不同食性條件下,仍然存在9.74%的共有腸道菌群,反映了鳥類腸道菌群在進化上的保守性。雄性和雌性大鴇在不同食性條件下,腸道菌群多樣性、組成和豐度存在顯著性差異,表明腸道菌群受到性別和食性的交互影響(圖1)。(3)通過比較同域越冬的大鴇和灰鶴腸道菌群,發現不同個體共有KEGG功能通路的比例達到39.43%,高于共有OUT的比例(8.87%),這表明腸道菌群在結構和功能上的保守性。宿主間菌群組成和功能通路的差異大于食性間的差異,表明宿主可能是決定腸道菌群特征和功能的主要因素,而食性則進一步推動了腸道菌群的分化(圖2)。

          本項目共發表SCI文章2篇,CSCD文章3篇,授權國家發明專利2件。項目研究結果為大鴇的系統發育以及種群精細管理提供了科學支撐,從遺傳學水平探索了鳥類適應環境變化的分子機制,揭示了宿主腸道菌群變化的影響因素,拓展了對鳥類如何應對環境變化的理解,為野生鳥類的保護和管理提供了科學支撐。(濕地所)

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